Касательно доп. соглашения, его выгодно подписывать если у вас есть рассрочка или какие-то условия, где оплата связана до разрешения на ввод.
В ином случае, вы просто соглашаетесь и теряете возможность взыскать с Застройщика неустойку за срок просрочки.